El 20 de mayo de 1929, la división aérea de la Marina de Guerra del Perú se convirtió en el Cuerpo de Aviación del Perú, recientemente fundada se enfrentó contra Colombia en la Guerra Colombo-Peruana entre 1932 y 1933, en la que sufrió el derribo de tres aviones, y también causó varios derribos.
En 1938 se convirtió en el Cuerpo Aeronáutico del Perú, en 1941 se enfrentó contra el Ecuador, consiguiendo plena superioridad aérea en el teatro de operaciones; en donde surge el Patrón de la Fuerza Aérea el Capitán José Abelardo Quiñones.
En 1950 adquirió su actual nombre: Fuerza Aérea del Perú. A lo largo de su historia ha sido referente en el subcontinente, por ejemplo, fue la primera en operar cazas supersónicos en Sudamérica (segunda en Latinoamérica después de Cuba) con los Mirage 5P en 1968, en 1985 es uno de los primeros operadores del Mirage 2000 en el Mundo obteniendo el caza de 4ta. Generación más avanzado de Sudamérica (2 años antes Venezuela había introducido el F-16 el primero de 4ta. Generación en la región). Fue la primera en Sudamérica en operar misiles BVR en 1996 con el R-27 desde los MiG-29. Y cuenta en la actualidad con la aeronave más especializada en CAS de América Latina.
Aunque en la última década haya pasado por sus horas más bajas, se vislumbra una mejora con los contratos de modernización e inspección mayor de la flota MiG-29, Mirage 2000 y Su-25. Con la mejora de la economía peruana se espera que la Fuerza Aérea del Perú vuelva a retomar su papel preponderante en la región.
Grupo Aéreo Nº 42 con sede en Iquitos, además de las Bases Aéreas de Pucallpa y Santa Clara, y los Agrupamientos Aéreos de Juanjí y Tarapoto - operando PC-6 y DHC-6
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