La siguiente, es la lista de apellidos originarios del Perú, en ella se destacan apellidos documentados de origen quechua, puquina, aimara, asháninca, entre otros.
Muchos de los apellidos surgieron como símbolo para fortalecer su identidad, identificándose con algún animal totémico prehispánico. Por los apellidos quechuas se nota claramente la identidad étnica de la persona, así como su origen social, o la etnia a la que pertenecieron sus antepasados y de las que ellos descienden.
La mayor concentración de personas con el apellido se ubica en las provincias de Puno, Arequipa, Cusco, Ilo y Moquegua, que corresponden al área tradicional de influencia colla.