Cada Comité Olímpico Nacional (CON) podía inscribir solo a un atleta. Los atletas se clasificaron en una de las seis zonas (Europa, América del Norte, América del Sur, Asia, Australasia y África) que contenían cinco atletas. Como anfitriones, a Argentina se le asignó un corredor y hasta 6 puestos estaban disponibles para la Comisión Tripartita, aunque no todos fueron utilizados; esto causó una reducción de los cupos de la zona dependiendo de la zona de donde fuese el atleta elegido. Los lugares restantes se decidieron a partir de los eventos de clasificación o de las clasificaciones 2017 del Desafío de Salto Mundial FEI (Categoría A). Si una zona no hubiera tenido suficientes atletas, el lugar sería ocupado por atletas de otra zona.[1][2]
Para ser elegible para participar en los Juegos Olímpicos Juveniles, los atletas debían haber nacido entre el 1 de enero de 2000 y el 31 de diciembre de 2003. Además, todos los corredores debían haber obtenido un Certificado de Capacidad. El certificado debía obtenerse entre el 1 de abril de 2017 y el 31 de mayo de 2018 en un evento registrado.[1]