Es el equipo con mayor número de presencias o temporadas en toda la historia del fútbol boliviano desde el inicio del fútbol nacional en 1954: 60 en total.
Posee el 2° puesto en cantidad de goleadores (15) en todos los torneos desde el comienzo del profesionalismo.
Posee el récord de ser el equipo que más ediciones ha disputado del Campeonato Nacional (1960-1976): (13).
Es uno de los 6 equipos que superaron la barrera de las 40 temporadas en Primera desde la creación de la Liga del Fútbol Profesional Boliviano hasta la actualidad.
Es uno de los 6 equipos que superaron la barrera de las 1000 partidos jugados en toda su historia desde la creación de la Liga del Fútbol Profesional Boliviano hasta la actualidad.
Es uno de los 6 equipos que superaron la barrera de las 2000 puntos desde la creación de la Liga del Fútbol Profesional Boliviano hasta la actualidad.
Es uno de los 6 equipos que históricamente en Primera División ganaron más partidos de los que perdieron.
Es uno de los 7 equipos que históricamente en Primera División tiene diferencia de gol favorable.
San José a enfrentado a un total de 6 campeones de la Copa Libertadores de América River Plate, Flamengo, São Paulo, Santos, Peñarol y Liga de Quito.
A nivel internacional llegó a los Octavos de final en la Copa Libertadores en la edición de 1996 y se convirtió en el quinto equipo en pasar de fase, es hasta la fecha juntó a 6 clubes los únicos que pasaron de fase en la Copa Libertadores de América.
San José ha logrado a lo largo de su historia contar con valiosos jugadores, destacándose entre ellos la presencia en su plantilla del campeón mundial argentino Daniel Valencia, quien pese a su veteranía, pudo dar muestras de su gran clase.
Único equipo boliviano que jugo ante un campeón mundial vigente: Copa Libertadores 2013 ante el Corinthians 1:1.
Es juntó a The Strongest los únicos que enfrentaron a un campeón de mundo. The Strongest en 2005 ante São Paulo y San José en 2013 ante el Corinthians.
Entre 1995 y 1996 San José estableció el récord de 46 partidos invicto como local. Es la segunda racha de partidos invictos más grande del fútbol boliviano.
Máximo campeón de torneos y copas de la Asociación de Fútbol Oruro (AFO) (14 Títulos).
Primer equipo del interior del país que llevó a más de 10 mil espectadores al Estadio Hernando Siles, ocurrió en la década del 90, la repercusión fue tal que Mario Mercado destacó a la hinchada de San José.
PJ=Partidos jugados; PG=Partidos ganados; PE=Partidos empatados; PP=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; Dif=Diferencia de gol; Pts. Puntos
Notas:
Se descontó un punto por incluir 5 extranjeros en cancha.
Se descontaron 3 puntos desde FIFA por deuda hacia un futbolista.