Atlas Celular Humano

El Atlas Celular Humano (también, Atlas de Células Humanas) es un proyecto para describir todos los tipos de células del cuerpo humano. La iniciativa fue anunciada por un consorcio tras su reunión inaugural en Londres en octubre de 2016, que estableció la primera fase del proyecto.​​ Aviv Regev y Sarah Teichmann definieron los objetivos del proyecto en esa reunión,​ convocada por el Instituto Broad, el Instituto Wellcome Trust Sanger y Wellcome Trust.​ Regev y Teichmann dirigen el proyecto.​

Descripción

El Atlas de Células Humanas catalogará una célula en función de varios criterios, concretamente el tipo de célula, su estado, su ubicación en el cuerpo, las transiciones que experimenta y su linaje.​ Recogerá datos de las investigaciones existentes y los integrará con los datos recogidos en futuros proyectos de investigación.​ Entre los datos que recogerá están el fluxoma, el genoma, el metaboloma, el proteoma y el transcriptoma.​

Su alcance es categorizar los 37 billones de células del cuerpo humano para determinar qué genes expresa cada célula tomando muestras de células de todas las partes del cuerpo.​

Todos los aspectos del proyecto se pondrán "a disposición del público de forma gratuita", incluido el software y los resultados.​

En abril de 2018, el proyecto incluía a más de 480 investigadores que realizaban 185 proyectos.​

Fondos

En octubre de 2017, la Iniciativa Chan Zuckerberg anunció la financiación de 38 proyectos relacionados con el Atlas Celular Humano.​ Entre ellos se encontraba una subvención de valor no revelado al Instituto Zuckerman del Centro Médico de la Universidad de Columbia. La subvención, titulada "A strategy for mapping the human spinal cord with single cell resolution", financiará la investigación para identificar y catalogar la actividad de los genes en todas las células de la médula espinal.​ El Instituto de Investigación Genómica Traslacional recibió una subvención para desarrollar un estándar para el "procesamiento y almacenamiento de tejidos sólidos para la secuenciación de ARN de una sola célula", en comparación con la práctica típica de basarse en la media de la secuenciación de múltiples células.​

El programa también cuenta con el respaldo de la Unión Europea, los Institutos Nacionales de Salud de Estados Unidos y la Fundación Manton.​

Datos

En abril de 2018, se publicó el primer conjunto de datos del proyecto, que representa 530,000 células del sistema inmunológico recolectadas de la médula ósea y la sangre del cordón umbilical.​

Un programa de investigación del Instituto Max Planck de Inmunobiología y Epigenética publicó un atlas de las células del hígado, utilizando la secuenciación de ARN de una sola célula en 10,000 células normales obtenidas de nueve donantes.​

Véase también

• atlas celular del ovario humano, que forma parte del Atlas Celular Humano.
• ENCODE - Enciclopedia de elementos de ADN (ENCODE)
• Proyecto Genoma Humano

 

Referencias

• Aizarani, Nadim; Saviano, Antonio; Sagar, Laurent Mailly; Durand, Sarah; Herman, Josip S.; Pessaux, Patrick; Baumert, Thomas F.; Grün, Dominic (10 de julio de 2019). «A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors». Nature 572 (7768): 199-204. PMC 6687507. PMID 31292543. doi:10.1038/s41586-019-1373-2. Consultado el 26 de diciembre de 2019. 
• Apple, Sam (22 de agosto de 2018). «The cartographer of cells». MIT Technology Review (September 2018). 
• Daley, Jason (19 de abril de 2018). «Human Cell Atlas releases first major data set». Smithsonian Magazine. Consultado el 26 de diciembre de 2019. 
• Farivar, Cyrus (30 de septiembre de 2017). «To better grok how all 37 trillion human cells work, we need new tools». Ars Technica. Consultado el 1 de octubre de 2017. 
• Nowogrodzki, Anna (5 de julio de 2017). «How to build a human cell atlas». Nature 547 (7661): 24-26. Bibcode:2017Natur.547...24N. PMID 28682347. S2CID 211067156. doi:10.1038/547024a. Consultado el 1 de octubre de 2017. 
• Preidt, Robert (17 de octubre de 2016). «Scientists plan to map every cell in the human body». CBS News. Consultado el 1 de octubre de 2017. 
• Regev, Aviv. «The Human Cell Atlas». Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology. Archivado desde el original el 13 de abril de 2021. Consultado el 1 de octubre de 2017. 
• Sample, Ian (14 de octubre de 2016). «Human Cell Atlas project aims to map the human body's 35 trillion cells». The Guardian. Consultado el 1 de octubre de 2017. 
• Silva, Catarina (20 de octubre de 2017). «Columbia researchers receive funding from Facebook founder to create atlas of spinal cord cells». ALS News Today. Consultado el 20 de octubre de 2017.  (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
• Yup, Sang (26 de junio de 2017). «Human Cell Atlas Opens a New Window to Health and Disease». Scientific American. Consultado el 1 de octubre de 2017. 
• «TGen develops processing procedures for 'single-cell' sequencing». AZ Big Media. 19 de octubre de 2017. Consultado el 20 de octubre de 2017. 
• «International Human Cell Atlas Initiative». Wellcome Trust Sanger Institute. 14 de octubre de 2016. Consultado el 1 de octubre de 2017. 

Otras lecturas

• Rozenblatt-Rosen, O.; Stubbington, M.J.T.; Regev, A.; Teichmann, S.A. (18 de octubre de 2017). «The Human Cell Atlas: from vision to reality». Nature 550 (7677): 451-453. Bibcode:2017Natur.550..451R. PMID 29072289. doi:10.1038/550451a. Consultado el 28 de abril de 2020. 

Enlaces externos

• Human Cell Atlas Meeting Participants (8 de mayo de 2017). The Human Cell Atlas. doi:10.1101/121202. Consultado el 1 de octubre de 2017. 
• Cepelewicz, Jordana (12 de julio de 2017). «Cell Atlases Reveal Biology's Frontiers». Quanta Magazine. Consultado el 1 de octubre de 2017. 
• «Human Cell Atlas data platform kicks off with support from CZI». Chan Zuckerberg Initiative. 1 de junio de 2017. Consultado el 4 de octubre de 2017. 
• Regev, Aviv (June 2017). «Creating a census of human cells». Nautilus. Archivado desde el original el 14 de abril de 2021. Consultado el 4 de octubre de 2017. 
• Yong, Ed (14 de octubre de 2016). «A Google Maps for the human body». The Atlantic. Consultado el 4 de octubre de 2017. 
• Ledford, Heidi (23 de febrero de 2017). «The race to map the human body — one cell at a time». Nature 542 (7642): 404-405. Bibcode:2017Natur.542..404L. PMID 28230136. doi:10.1038/nature.2017.21508. Consultado el 1 de octubre de 2017. 

• Datos: Q93047373